渔业工程研究所1978年由国家批准成立，是我国唯一从事渔业工程研究的科学研究单位，承担着我国渔业工程与装备学科领域的基础性、关键性和方向性重要科技任务。是农业农村部相关部门渔业工程技术重要支撑单位，是中国水产科学研究院十大优势学科中“渔业工程与装备”学科的重要实施单位，是中国水产学会渔业工程专业委员会的技术服务单位。经过30多年建设和发展，取得研究设计成果140余项，其中获得国家级奖励2项，省部级奖励11项，院级奖励6项。在渔港与渔场工程、设施渔业工程、渔业船舶工程、渔业防灾减灾、渔业信息工程等专业领域中学科特色突出，在渔业工程、渔业生态环境修复研究、科技咨询、学术交流和国际合作等方面开展了卓有成效的工作。在全国渔业工程科技攻关，服务宏观决策，实现渔业大国向渔业强国转变等重要方面，发挥了不可替代的作用。渔业工程研究所现有编制80人。科技人员77人，在编在职人员64人，科技人员中，高级职称20人，本科以上62人。